L’activité première d’ENPRO est la pré-collecte des déchets ménagers, débutée en 2000 à Lomé.

C’est la commune qui aujourd’hui est en charge d’organiser la gestion des déchets sur son territoire. La collecte des déchets est réalisée à travers un schéma à deux maillons, la pré-collecte d'une part, allant depuis les ménages jusqu’au site de compostage, et la collecte d'autre part, allant du site de compostage jusqu’au nouveau CET, construit récemment par la commune et situé à Aképé.

En 2008, ENPRO s’est constituée en entreprise et a répondu à l’appel d’offre lancé par la commune de Lomé. Elle a ainsi obtenu le lot de la pré-collecte du quartier d’Agbalépédogan dans le 5ème Arrondissement de Lomé, Arrondissement qui compte 88 298 habitants et produit près de 20 000 tonnes de déchets chaque année.